MVR薄膜蒸发器由于运行的低成本性及操作简单性，越来越被有需求用户认可。但是MVR薄膜蒸发器并不适用于所有物料。
对于一些杂质含量较高、含固率较高的、沸点升高较高的物料不合适。因为MVR薄膜蒸发器的热源是二次蒸汽通过压缩机提高焓值后作为热源再利用，一般情况下二次蒸汽的温度提高值在≤20，热源和被蒸发的液体沸点之间需要一定的温度差才能有蒸发的推动力，因此，沸升较高的物料不适合使用MVR薄膜蒸发器。但是在蒸发过程中如果蒸发量较大，在前期很大蒸发量沸点升高不是很高的情况下，可以与多效蒸发器分段进行处理，前部分采用MVR薄膜蒸发器，后部分浓度高沸点高后采用多效蒸发器。
对于一些腐蚀性极强的物料需慎重选择，因为二次汽作为热源使用，有一定的腐蚀性，因此对压缩机的材质要求较高，这样会增加设备的投资费用。